安徽省加大改革力度，积极探索研究小型水利工程建设管理机制，充分调动社会力量参与小型水利工程管理，加快小型水利工程改造提升和管理创新，实现小型水利工程的良性运行管理。
一是做好顶层设计，从深层次激发各地改革的动力。2013年初，安徽省确定了“农田水利建设提升与管理创新年”活动的主题，一手抓工程建设提升，一手抓管理体制创新。印发了《全省小型农田水利工程管理改革创新试点工作方案》，安排试点经费和单位，在深入调研、总结试点单位经验的基础上，出台《关于深化改革推进小型水利工程改造提升的指导意见》，提出了“明确事权划分、理顺产权关系，坚持政府主导、鼓励多元投入，加强指导监管、支持自主建设，发挥工程效益、创新管护机制，配套扶持政策、培育市场主体”五项改革措施，同步完善小型水利工程投资、建设和管理维护的长效机制。
二是明晰工程产权，探索解决“工程权属”的问题。按照“谁投资、谁所有、谁受益、谁负担”的原则，结合安徽实际，对现有小型水利工程，按原产权归属和受益情况确定其所有权和使用权。对新建小型水利工程，探索按“谁投资、谁所有、谁使用”的办法，确定其所有权和使用权。针对土地流转规模扩大和新型农业生产经营主体发展壮大的趋势，对土地承包经营权已约定流转给新型农业生产主体地域内的小型水利工程，原产权不变，使用权和管理权流转给新型农业主体。
三是落实主体责任，探索解决“工程由谁来管”的问题。结合安徽的实际，试点探索“两证一书”制度，即确定产权主体，颁发所有证；落实管护主体，颁发使用证；明确各方责任，签订管护责任书。对于一家一户分散经营受益的工程，指导受益范围农户建立用水户协会、水利合作社、村民理事会等加强管理。对新型农业生产经营主体承包范围内的工程，签订管护协议委托其管理使用，指导其建立管理制度，规范运行机制。
四是多方筹集经费，探索解决“资金如何落实”的问题。多渠道筹集工程管护经费，建立管护经费保障机制。在坚持政府主导、加大财政投入的同时，有效鼓励和引导民间资金多元投入，主要明确了几个方面的资金渠道。一是市、县财政设立小型水利工程管理和维修养护专项经费，纳入财政预算并逐步增加资金规模。二是各县区可从下达的农水项目和涉水项目工程经费中提取1%，用于小型水利工程管护。三是受益主体和农户通过“一事一议”提取部分管护经费。四是从土地出让金和水利基金中提取部分管护经费。五是利用水土资源和吸收社会资金，用于小型水利工程管护。
五是创新管理模式，探索解决“工程如何管护”的问题。针对不同类型工程特点，因地制宜采取专业化集中管理及社会化管理等多种管护方式。安徽省主要探索了5种新型管护组织。一是按行政区划以乡或村民组成立水利维修养护公司，二是以工程类别成立水利养护公司，三是以水利合作社（用水户协会）承担小型水利工程管理维护，四是由乡政府或村委会将小型水利工程打捆发包，“花钱买服务”管理维护，五是由新型农业生产经营主体对经营范围内的工程进行管理维护。
