12月23日提交第十二届全国人大常委会第十二次会议审议的《国务院关于国家财政水利资金投入和使用工作情况的报告》显示，“十二五”前三年，全国财政水利资金累计投入13261亿元，年均增长19％。
2011年初印发的《中共中央国务院关于加快水利改革发展的决定》提出，要把水利作为国家基础设施建设的优先领域，力争今后10年全社会水利年平均投入比2010年高出一倍。
财政部部长楼继伟介绍，2011年以来，财政水利资金投入稳定增长机制逐步建立。资金主要来自一般公共预算和政府性基金预算两个渠道。
最大头来自一般公共预算。2011－2013年，全国一般公共预算安排水利投入9423亿元，占财政水利总投入的71％。
其余资金来自政府性基金预算。2011－2013年，全国政府性基金预算安排水利投入3838亿元，占财政水利总投入的29％。
楼继伟指出，财政水利资金分为中央和地方两大块，中央约占46％，地方约占54％。中央财政水利资金分配管理与现行管理体制密切相关，主要涉及财政部、发展改革委、水利部、南水北调办、三峡办等部门。
对于国家财政水利资金的投向，楼继伟介绍，主要是突出支持水利关键领域和薄弱环节，包括农村饮水安全工程建设、重大骨干工程建设、农田水利等薄弱环节建设、完善防汛抗旱减灾体系、南水北调工程建设、水生态文明建设、大中型水库移民后期扶持以及实施三峡后续工作规划等领域。
楼继伟表示，下一步财政部主要有六方面工作打算：
首先是理顺政府与市场的关系。要在继续坚持政府主导办水利的同时，加快建立政府和市场有机结合的机制，更加充分地发挥市场机制的作用。
二是研究界定中央与地方的支出责任。在研究明晰中央事权、地方事权、中央与地方共同事权的基础上，进一步明确中央与地方各自承担，以及共同承担的支出责任。
三是完善财政水利资金预算管理机制。包括优化转移支付体系；改进预算管理和控制；加强财政水利资金绩效管理。强化支出责任和效率意识，健全预算绩效管理制度和机制，全面推进预算绩效管理工作。
四是优化财政水利资金支出结构。包括大力支持重大水利工程建设；大力支持民生水利建设；大力支持生态文明建设；稳步推进地下水超采综合治理。
五是支持加快水利重点领域改革。包括加快完善农田水利建设和管护机制；加快推进农业水价改革；加快建立生态补偿机制；支持推动建立水权制度。
六是改进和加强财政水利资金监管。包括进一步健全制度体系；进一步改进资金分配和项目管理；大力推行信息公开；强化监督检查。建立健全水利资金分配使用的风险防控机制，加强对重点风险环节和领域的监控。强化审计监督、财政监督和水利稽察，进一步发挥社会监督的作用。加大对重点区域和重点项目的检查力度，加强对基层资金使用情况的监管，突出解决好挤占、挪用、套取资金等问题。
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