近30年来，广东省深圳市经济水平突飞猛进的同时，深圳湾的水质却并没有得到提高。专家认为，污水处理厂和地下管网建设的滞后性，导致污水只能直排大海,这直接影响了水质提升的效果。纵观近30年来深圳湾的水质，水污染的治理速度与深圳经济的发展速度并不协调。
30年来水质不断恶化
多位专家学者的研究表示，近30年来，深圳湾水质呈现不断恶化的趋势，深圳湾及珠江口海域污染严重，主要超标因子为无机氮和活性磷酸盐。
香港大学博士王越兴在其《深圳湾水环境质量及变化趋势分析》中写道，数据表明，20世纪80年代深圳湾水质尚可，1987年深圳湾水质符合Ⅲ类海水水质标准。1990年之后，深圳湾出口处水质急剧恶化，水质基本为劣Ⅳ类。
《2014年深圳市海洋环境状况公报》显示，去年深圳西部海域海水水质均劣于第四类海水水质标准，主要超标因子是无机氮、活性磷酸盐，部分海域溶解氧含量较低。
绿源志愿小组认为，深圳湾十几公里休息带中的雨水排污口持续排放着生活污水，原因是这一带的市政管网的建设远远落后于房地产项目的建设，小区污水排入雨水管，雨污混流，导致深圳湾出现严重的水质污染。湾内严重的水污染问题与深圳的高速城市发展形成较大反差，已成为制约深圳经济与生态和谐发展的重要因素。
人口暴增带来污染新难题
王越兴说，在1993年之前，深圳湾流域仅有滨河污水处理厂和南山污水处理厂投入运行，处理能力为10万L/d，但这不足以有效消除因人口急剧增长而增加的污染负荷。
之后随着蛇口污水处理厂、滨河三期、南山污水处理厂二期，尤其是排海工程、罗芳污水处理厂的相继投入运行，深圳湾的水质有较大改善，活性磷酸盐及无机氮浓度基本接近达标。但2001年之后，由于人口的继续快速增长，无新的污水处理厂投入运行，滨河污水处理厂改造等原因，导致污染物浓度又一次上升，到2006年达到顶峰。2006年布吉应急工程投入运行，有效改善了布吉河水质，使深圳湾水质有所改善。
近年来，随着后海片区房地产的迅速崛起，地下排污管网建设已经落后于地面建设速度。深晚记者查阅资料发现，后海片区存在数十个楼盘，每天产生的数万吨污水因为南山污水处理厂无法收纳、甚至部分管道建设未成，存在通过地下雨水管直排大海的情况。
