被问到节能减排到底还存在什么样的困难和问题时，吕文斌表示，注意到这些问题了，简单归纳一下。节能减排困难和问题有这样五点：一是认识不到位。中央提出不要简单以GDP论英雄，要更加注重发展的质量效益。但我们的认识还没有完全适应新形势新任务的要求，对传统发展路径的依赖尤为明显，有的认为节能减排是对经济发展“做减法”，对淘汰落后产能决心不大，有的甚至还在上一些高消耗、高排放和产能过剩项目。
二是部分指标完成进度滞后。单位GDP能耗和氮氧化物排放量下降率前三年分别只完成五年总任务的54.3%和20%，与60%的进度要求还有明显差距。要实现“十二五”目标，后两年单位GDP能耗须年均降低3.9%以上，氮氧化物排放量须年均下降4.2%以上，远高于前三年平均降幅。所以说难度比较大。
三是发展方式依然粗放。我们有一组数据，2012年我国经济总量占世界的比重为11.4%，但消耗了全世界21.3%的能源、54%的水泥、45%的钢、43%的铜。这些消耗的能源资源量还是比较大的。2013年煤炭占能源消费比重达65.9%，能源结构煤炭还是占主要比重。能耗强度大大高于世界平均水平，主要工业产品能耗比国外先进水平高10-20%以上，一些落后技术设备仍在使用，所以说转方式、调结构的任务艰巨。
四是政策机制不完善。随着当前煤炭价格走低，财政奖励的激励作用弱化，企业节能改造积极性不高。燃煤电厂，特别是落后的氮氧化物指标，脱硝电价政策出台时间较晚，脱硝工程建设滞后。黄标车和老旧车淘汰及畜禽污染防治激励措施不足。
五是基础工作薄弱。节能环保标准不完善，有的标准缺失，有的标准没有及时修订，满足不了工作需要。执法能力偏弱，守法成本高、违法成本低的问题仍未有效解决。节能计量、统计、监测工作有待加强。这应该说是当前节能减排工作中存在的一些主要困难和问题。
