《方案》提出，创新生态保护制度，探索建立国家公园体制，加速推进国家生态文明先行示范区建设，进一步提升生态保护层次。到2020年，森林资源恢复到上世纪70年代水平，国家公园体制基本建立，生态文明建设体制机制基本健全，形成节约资源和保护环境的空间格局、产业结构、生产方式和生活方式。
在建立生态保护红线制度上，落实主体功能区制度，划定森林、湿地、植被、物种4条生态保护红线。探索编制自然资源资产负债表，健全领导干部自然资源资产离任审计制度，建立生态环境损害责任终身追究制，完善符合生态功能区建设要求的考核制度。
在探索建立资源有偿使用和生态补偿制度上，完善生态价值评估、生态建设年度报告制度。研究建立碳交易权、排污权、水权等资源评估交易体系，争取开展森林生态效益补偿试点和森林碳汇交易试点。建立吸引社会资本投入生态环境保护的市场化机制，推行环境污染第三方治理。
在完善环境保护管理制度上，建立和完善严格监管所有污染物排放的环境保护管理制度。完善污染物排放许可制度，实行企事业单位污染物排放总量控制制度。健全环境保护目标责任制和环境影响评价制度，对造成生态环境损害的责任者严格实行赔偿制度，依法依规追究责任。
